הנדסה
תאגיד מעיינות הדרום אחראי על 4 מכונים לטיפול בשפכים:
מכון טיהור שפכים בדימונה – מטפל בכ - 2,000,000 מ"ק שפכים בשנה.
מכון טיהור שפכים בערד – מטפל בכ – 1,500,000 מ"ק שפכים בשנה.
מכון טיהור שפכים בירוחם – מטפל בכ – 700,000 מ"ק שפכים בשנה.
מכון טיהור שפכים במצפה רמון – מטפל בכ – 400,000 מ"ק שפכים בשנה.
במכון טיהור דימונה מטוהרים כ- 30% מהשפכים לאיכות שלישונית. הקולחים המטוהרים משמשים להשקיה ציבורית ברחבי העיר ולהשקיית גידולים חקלאיים. במהלך שנת 2015 יטוהרו יתרת 60% גם הם לאיכות שלישונית.
במכון טיהור ערד מטוהרים כ- 100% מהשפכים לאיכות שלישונית. הקולחים המטוהרים משמשים להשקיה להשקיית גידולים חקלאיים.
במכון טיהור ירוחם מטוהרים כ- 100% מהשפכים לאיכות שלישונית. הקולחים המטוהרים משמשים להשקיה פארק ירוחם.
במכון טיהור מצפה רמון : בסוף שנת 2014 יוקם מערך טיפול שלישוני לטיפול כל שפכי המכון. הקולחים המטוהרים משמשים להשקיה להשקיית גידולים חקלאיים.